Trayectoria en el Brujas

Club Brujas

Carlos Bacca durante un entrenamiento con el Club Brujas.

Luego de obtener tan buenos resultados con el Junior de Barranquilla se confirmo su traspaso al Brujas de la Primera División de Bélgica³ , por un monto que fue no fue revelado por decisión de su representante⁴ . El anhelado debut en Europa se da el 21 de enero de 2012, una semana después de ser transferido al club belga, substituyendo a Lior Rafaelov en el minuto 68, pero ese día no pudo evitar que su equipo cayera 1 a 0 contra el RKV Malinas. En su quinto partido con el club belga, anota su primer gol, fue en la cuarta fecha de los play-offs de la liga belga, en la victoria 1 a 0 frente KAA Gent. Un par de fechas después, anota un doblete en la victoria 2 a 1 de su equipo frente al Genk, logrado su tercer gol de la temporada en Bélgica, y consolidando al club belga de su subcampeonato y de su cupo a la Liga de Campeones 2012/13.
Durante la pretemporada 2012/13 del Brujas, anota una tripleta frente al HSV Hoek, en la victoria 7 a 4 del Brujas, de esta manera paso a ser el goleador del Brujas en la pretemporada con 5 goles.
Ya en la liga belga, por la cuarta fecha anota su primer gol en la temporada 2012/13. Por una de las fases de clasificación de la Liga Europa (Europa League), tras la eliminación del Brujas del repechaje para jugar la Champions League, anota su primer gol por el certamen continental y siendo este es su segundo gol en la temporada y el quinto que hace con el club belga. Una semana después, anota el el tercer gol del Brujas en la victoria 1 a 3 sobre el Mons. Tras su buen arranque de temporada, el diario Marca de España lo relaciona con el RCD Español de Barcelona. Unos días después de esta noticia, anota en la segunda fecha de la fase de grupos de la Europa League en la victoria 2 a 0 del Brujas sobre el Maritimo de Portugal, siendo su tercer gol del torneo (incluyendo los 2 goles en la fase previa). El 23 de Octubre de 2012 es elegido como el mejor jugador de la liga belga en el mes de septiembre.
Al finalizar la temporada fue goleador de la Jupiter League 2012/13 con 25 goles y fue galardonado como el mejor jugador de la temporada 2012/13 de la primera división belga.